MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK2

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010466	AATT	2	8	98	105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010466	TTA	2	6	460	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010466	TCA	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010466	TTA	2	6	489	494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010466	ATA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010466	GAG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010466	C	7	7	583	589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_010466	T	6	6	616	621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010466	CAT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010466	CCA	2	6	693	698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010466	CAG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010466	A	6	6	804	809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010466	ACAA	2	8	811	818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010466	AG	3	6	856	861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010466	TTC	2	6	878	883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010466	TAT	2	6	891	896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010466	GTATTA	2	12	903	914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010466	TGT	2	6	942	947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010466	CTA	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010466	AGG	2	6	969	974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010466	TTTA	2	8	1127	1134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010466	GTA	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010466	TATT	2	8	1174	1181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010466	ATTTT	2	10	2228	2237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010466	TAT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010466	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010466	CCG	2	6	2375	2380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010466	ATA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010466	ACTAT	2	10	2513	2522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010466	GAG	2	6	2568	2573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010466	TAA	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010466	GATA	2	8	3926	3933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010466	CAT	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010466	CAAA	2	8	3962	3969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010466	TGTTT	2	10	4012	4021	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010466	TTA	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010466	TAT	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010466	GT	3	6	4104	4109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010466	A	7	7	4155	4161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010466	AAG	2	6	4262	4267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010466	AGA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010466	GAGAA	2	10	4481	4490	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010466	TTG	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010466	AGCC	2	8	4797	4804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010466	TGGC	2	8	4821	4828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010466	TTG	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010466	TGA	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010466	CAT	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010466	T	7	7	4912	4918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010466	TCA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010466	A	6	6	5050	5055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010466	CCA	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010466	TTA	3	9	5128	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010466	T	7	7	5147	5153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010466	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010466	TTGA	2	8	5222	5229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010466	GAA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010466	A	7	7	5281	5287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010466	CAAA	2	8	5295	5302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010466	GTC	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010466	A	7	7	5397	5403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010466	CTA	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010466	TTGT	2	8	5543	5550	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010466	AGT	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010466	T	6	6	5604	5609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010466	ACA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010466	TGT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010466	ATA	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010466	A	6	6	5778	5783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010466	ATGT	2	8	5785	5792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010466	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010466	ATTT	2	8	5838	5845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010466	TTAA	2	8	5849	5856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010466	AAT	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010466	GTA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010466	T	7	7	5935	5941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010466	T	6	6	5947	5952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010466	GTA	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010466	TAT	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010466	TAAA	2	8	6008	6015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010466	TAC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010466	GTA	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010466	TAT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010466	TAG	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010466	GAG	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010466	A	6	6	7393	7398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010466	AAGT	2	8	7489	7496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010466	A	7	7	7579	7585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010466	TTTA	2	8	7595	7602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010466	AGC	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010466	TTGG	2	8	7881	7888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010466	AAATT	2	10	7974	7983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010466	A	6	6	11368	11373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010466	TAAC	2	8	11385	11392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010466	TAG	2	6	11405	11410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010466	TC	3	6	11900	11905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010466	T	7	7	11952	11958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010466	CTT	2	6	12439	12444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010466	TTC	2	6	12456	12461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010466	AAG	2	6	12487	12492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010466	A	6	6	12508	12513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010466	CTA	2	6	12586	12591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010466	GCAA	2	8	12609	12616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010466	A	6	6	12638	12643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010466	AAG	2	6	12695	12700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010466	CT	3	6	14095	14100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010466	A	6	6	14498	14503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010466	CTC	2	6	14510	14515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010466	TTA	2	6	14534	14539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010466	TCC	2	6	14693	14698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010466	TCT	2	6	14726	14731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010466	TTC	2	6	14738	14743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010466	ATA	2	6	14758	14763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010466	AAT	2	6	14774	14779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010466	T	6	6	14824	14829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010466	TTC	2	6	14857	14862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010466	CCAA	2	8	14869	14876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010466	TTG	2	6	15901	15906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010466	AGC	2	6	15913	15918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010466	TCT	2	6	16065	16070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010466	ATA	2	6	16081	16086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010466	T	6	6	16098	16103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010466	A	6	6	16119	16124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010466	TTG	2	6	16141	16146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010466	GAA	2	6	16314	16319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010466	TCGC	2	8	16406	16413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010466	ACG	2	6	17242	17247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010466	TTG	2	6	17302	17307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010466	ACC	2	6	17348	17353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010466	TC	3	6	17359	17364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010466	ATA	2	6	17746	17751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010466	TAAT	2	8	17794	17801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010466	ACA	2	6	17840	17845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010466	A	8	8	17852	17859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010466	CAAC	2	8	17902	17909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010466	AGA	2	6	17938	17943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010466	ACA	2	6	17948	17953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010466	ATT	2	6	17964	17969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010466	ACA	2	6	17990	17995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010466	AAT	2	6	18057	18062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010466	AT	3	6	18089	18094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010466	TAT	2	6	18120	18125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010466	GCGA	2	8	18194	18201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010466	TTG	2	6	18213	18218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010466	TTG	2	6	18274	18279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010466	A	6	6	18280	18285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010466	ATT	2	6	18297	18302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010466	A	6	6	18317	18322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010466	CAG	2	6	18350	18355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010466	CTATA	2	10	18438	18447	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_010466	AT	3	6	18464	18469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010466	A	8	8	18498	18505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010466	TCA	2	6	18511	18516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010466	AAT	2	6	18569	18574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010466	GGA	2	6	18579	18584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010466	GTC	2	6	19978	19983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_010466	TGT	2	6	24056	24061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010466	TTAA	2	8	24063	24070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010466	CATC	2	8	24166	24173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_010466	GAT	2	6	24239	24244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010466	AGA	2	6	24311	24316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010466	TTA	2	6	24416	24421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010466	T	7	7	24462	24468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010466	ATA	2	6	24479	24484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010466	AAG	2	6	24493	24498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010466	TCA	2	6	24518	24523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_010466	ATAA	2	8	24524	24531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010466	AATTA	2	10	24534	24543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010466	TTTA	3	12	24544	24555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010466	ATT	2	6	24556	24561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010466	TA	3	6	24576	24581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010466	AAT	2	6	25198	25203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010466	TGCGAT	2	12	25242	25253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_010466	AT	3	6	25265	25270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010466	GCT	2	6	25280	25285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_010466	TCC	2	6	26050	26055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_010466	GT	3	6	28836	28841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010466	T	6	6	28848	28853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_010466	T	7	7	28867	28873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_010466	AGAA	2	8	28926	28933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_010466	ATTT	2	8	28952	28959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010466	ATG	2	6	28981	28986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010466	CAG	2	6	29057	29062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_010466	CAC	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_010466	AGCC	2	8	29085	29092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
186	NC_010466	TTG	2	6	29108	29113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_010466	TCC	2	6	29122	29127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_010466	TAC	2	6	29163	29168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_010466	GAT	2	6	30800	30805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_010466	CCT	2	6	31444	31449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.